رزفایل

مرجع دانلود فایل ,تحقیق , پروژه , پایان نامه , فایل فلش گوشی

رزفایل

مرجع دانلود فایل ,تحقیق , پروژه , پایان نامه , فایل فلش گوشی

مقاله ای کامل در مورد پروتئین ها

اختصاصی از رزفایل مقاله ای کامل در مورد پروتئین ها دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

مقاله ای کامل در مورد پروتئین ها


مقاله ای کامل در مورد پروتئین ها

این مقاله17 صفحه ای در قالب word بوده و تمامی صفحات آن دارای حاشیه و همچنین پس زمینه میباشد و آماده پرینت نیز میباشد و به شرح کامل تمام مطالب مرتبط با پروتئین ها به صورت کامل پرداخته است.

قسمت هایی از مقاله :

مقدمه:

پروتئین ها مواد آلی بزرگ و یکی از انواع درشت‌ملکول‌های زیستی هستند که از زیرواحدهایی بنام اسید آمینه ساخته شده‌اند. پروتئین‌ها مانند زنجیری از یک کلاف سه‌بعدی بسپارهایی هستند که از ترکیب اسیدهای آمینه حاصل می‌شوند. اسیدهای آمینه مثل یک زنجیر خطی توسط پپتاید باند میان گروه های کرباکسیل و آمینو مجاور به یکدیگر متصل میشوند تا یک پالی پپتاید را بوجود بیاورند. ترتیب اسیدهای آمینه در یک بروتئین توسط ژن مشخط میشود. اگرچه کد ژنتیک 20 تا اسید آمینه استاندارد را معرفی میکند، گاهی در پروتئین ها دگرگونی بوجود میاید

 و ادامه مقاله


دانلود با لینک مستقیم


مقاله ای کامل در مورد پروتئین ها

دانلود تحقیق کامل درباره نقش پروتئین ها در رژیم غذایی 11 ص

اختصاصی از رزفایل دانلود تحقیق کامل درباره نقش پروتئین ها در رژیم غذایی 11 ص دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

لینک دانلود و خرید پایین توضیحات

فرمت فایل word  و قابل ویرایش و پرینت

تعداد صفحات: 11

 

نقش پروتئین ها در رژیم غذایی

پروتئین ها مواد مغذی اصلی هر سلول زنده هستند. در ساختمان آنها نه تنها کربن، هیدروژن و اکسیژن وجود دارد، بلکه ازت و گاهی گوگرد نیز موجود می باشد.

پروتئینها مسئول انجام اعمال گوناگونی هستند. نقش آنها از تشکیل ماده انقباضی عضلات گرفته تا ساختن بعضی از هورمون ها، آنزیم ها و آنتی کورها، تبدیل انرژی شیمیایی به کار و انتقال اکسیژن و هیدروژن متنوع می باشد.

ویژگیهای فیزیکو– شیمیایی پروتئین ها

الف) از هیدرولیز پروتئین ها اسیدهای آمینه بدست می آید.

تعداد اسیدهای آمینه بیست عدد می باشد که بعضی از آنها «اساسی» هستند که عبارتند از : لیزین, تریپتوفان فینل آلائین, متیونین, ترئونین, لوسین و والین و چون بدن انسان قادر نیست آنها را بسازد، حتماً باید توسط غذا تأمین گردند.

ب ) با ترکیب اسیدهای آمینه با هم، پلی پپتیدها بوجود می آیند. از ترکیب پلی پپتیدها با هم، تعداد قابل توجهی مولکول پروتئین حاصل شود.

متابولیسم اسیدهای آمینه

اسیدهای آمینه شکل نهایی متابولیسم پروتئین ها هستند، قابل انتشار بوده و شامل مواد ساده‌ای است که مصارف مختلفی دارند:

الف) ذخیره موقتی در بافت ها

ب) سنتز پروتئین ها: با اسیدهای آمینه بافتهای مختلف، پروتئین ها سنتز می شوند.

ج) دز آمیناسیون – ترانس آمیناسیون: با سوختن اسید آمینه، بعد از آنکه اسید آمینه عامل آمینی (NH2) را از دست داد، یک اسید چرب باقی می ماند که حدوداً 90 درصد انرژی موجود در اسید آمینه را در بر می گیرد و در زمان کمبود انرژی یا مصرف بیش از حد پروتئین، اسید آمینه پس از دست دادن ازت خود می سوزد.همچنین اسیدهای آمینه در بدن با جا به جا کردن ازت (ترانس آمیناسیون) به یکدیگر تبدیل می شوند.

مقدار مورد نیاز پروتئین برای یک ورزشکار

پس از اینکه فرد ورزشکار از میزان انرژی مورد نیازش اطلاع کافی به دست آورد، بایستی 15 تا 17 درصد میزان انرژی را به دست آورده ، تقسیم بر عدد 4 کند ، عدد به دست آمده گرم پروتئین مورد نیاز ورزشکار است که باید از طریق غذا در طول روز تامین شود. برای ورزشکارانی که نیاز به افزایش حجم عضلات دارند، از 17 درصد و برای دیگر ورزشکاران از 15درصد انرژی، برای محاسبه پروتئین مورد نیاز باید استفاده کرد.

17 – 15 درصد میزان انرژی مورد نیاز ورزشکار (تقسیم بر) 4 = گرم پروتئین مورد نیاز ورزشکار

منابع غذایی پروتئین ها

پروتئین ها بخشی از ترکیبات مواد غذایی هستند که با مقدارهای مختلف در آنها موجودند.

پروتئین های دارای منشاء حیوانی کیفیت خوبی دارند. با وجود این بعضی از مواد غذایی گیاهی «حبوبات، غلات، نان...) دارای مقادیر کمی پروتئین هستند که ارزش حیاتی آنها پایین تر از پروتئین های حیوانی است، اما به مقدار آنها جالب توجه هستند. در مورد منابع غنی از پروتئین بطور کامل توضیح می دهیم:

1-گوشت قرمزگوشت های گاو، گوسفند، اسب، صرف نظر از آنکه چه قسمتی از بدن حیوان باشد، دارای ویژگیهای تغذیه ای شبیه به هم هستند. مزّیت تغذیه ای گوشت به غنای پروتئینی آن بستگی دارد (15 تا 20% گوشت، پروتئین است). گوشت غنی از فسفر، آهن و ویتامین های گروه B (مخصوصاً B1 ) است. میزان چربی های آن بر حسب نوع حیوان و قسمت بدن به طور قابل توجهی متغیراست. به طور متوسط 170 کیلوکالری برای هر 100 گرم، انرژی تولید می کند. ارزش غذایی « گوشت قرمز برابر گوشت سفید» است. گوشت کاملاً پخته شده همان ارزش گوشت خام یا گوشتی را دارد که مختصراً پخته شده باشد. اما پختن کامل برای از بین بردن انگل ها (مخصوصاً تنیا ) لازم است.

ویژگیهای خاص بعضی از گوشت های قرمز

- گوشت گوسفند اغلب چرب است، حتی وقتی کم چربی ترین بخش های آنها مصرف گردد. - گوشت گوساله غنی از نوکلئوپروتئین ها است و مصرف خیلی زیاد آن می تواند عمل عضلات را مختل کند.

- اسب دارای گوشت کم چربی است (2% چربی). برخلاف آنچه مدتهای مدید فکر می شد، نباید بصورت خام مصرف شود.

- گوشت ها ترجیحاً بهتر است بصورت کباب یا بریان شده مصرف گردند و از گوشتهای سرخ شده، روغن پرشده، آبگوشت و سس های چرب که دارای هضم مشکل هستند، خودداری شود.

- گوشتهای چرخ شده نباید مصرف گردند، مگر با رعایت احتیاط کافی و بصورت گوشت چرخ شده و یخ زده . اگر گوشت را در منزل، خودتان چرخ کرده و تا دو ساعت بعد، آن را مصرف کنید خیلی بهتر است و یا اینکه چرخ کردن گوشت توسط فروشنده در مقابل خودتان انجام شود و تا دو ساعت بعد مصرف گردد یا در دمای 19- درجه فریز شود.

- گوشتها را نباید بصورت خام مصرف کرد.

برای خریداری گوشت حتماً به تازگی و زمان تولید آن دقت کنید و برای نگهداری طولانی در دمای 18- درجه نگهداری شود.

نگهداری طولانی مدت و کیفیت بهداشتی پایین، ارزش غذایی پروتئین موجود در گوشت را کاهش می دهد.

2-فرآورده های امعاء و احشاء، ماکیان و گوشت شکار

الف) امعاء و احشاء: زبان و دل دارای ارزش تغذیه ای نزدیک به گوشت هستند.

- جگر از جالب ترین احشاء است. به همین جهت است که مصرف یک بار در هفته آن را برای ورزشکاران توصیه می کنیم (اما نباید بیش از یک بار در هفته مصرف گردد چون دارای نوکلئو پروتئین ها و کلسترول است). جگر یک منبع قابل توجه پروتئین( 20 تا 22 درصد)، آهن، عناصر کمیاب، فسفر، ویتامین های گروه B (B1, B2, B6, pp, B12) و ویتامینAاست. جگر بره دارای ارزش تغذیه ای معادل جگر گاو(غنی ترین جگر) است.

- امعاء و احشاء دیگر: پاچه، کله، سیرابی، و مغز از نظر بافت عضلانی فقیر، اما غنی از نظر نوکلئو پروتئین ها هستند و قابل مقایسه با ارزش تغذیه ای جگر نمی باشند. پس آنها را باید خیلی کم مصرف کرد. چون دارای چربی زیاد هستند، خصوصا در زمان پیش از مسابقات نباید مصرف شوند.


دانلود با لینک مستقیم


دانلود تحقیق کامل درباره نقش پروتئین ها در رژیم غذایی 11 ص

تحقیق پروتئین ها 18 ص

اختصاصی از رزفایل تحقیق پروتئین ها 18 ص دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

لینک دانلود و خرید پایین توضیحات

فرمت فایل word  و قابل ویرایش و پرینت

تعداد صفحات: 19

 

پروتئین ها

مهم ترین نقش پروتئین ها در در بدن، رشد و ترمیم بافت های بدن است. بسیاری از مردم بر این عقیده هستند که ورزشکاران به مقدار زیادی پروتئین نیاز دارند و رژیم آنها باید از مقدار پروتئین بالایی برخوردار باشد، تا ماهیچه های آنها رشد کنند. اما محققان بارها و بارها در آزمایشات و تحقیقات خود، چنین نظریه ای را غلط بر شمرده اند و این موضوع که رژیم پروتئین باعث رشد و افزایش ماهیچه ها می شود، نادرست است. تنها عاملی که باعث افزایش حجم عضلات بدن می شود، انجام تمرینات شدید و مداوم است.

مصرف پروتئین در ورزشکاران و افرادی که به تمرینات بدنسازی می پردازند، در مقایسه با افراد معمولی، تنها مقدار بسیار کمی افزایش می یابد و البته اغلب آنها این مقدار ناچیز را از راه خوردن غذای زیاد جبران می کنند. به طوری که اغلب ورزشکاران آمریکایی بیش از نیاز بدنشان پروتئین مصرف می کنند و حتی این مقدار به دو وعده در روز می رسد.

 بنابراین بدن افراد برای افزایش عضلات و ماهیچه ها، پیش از آنکه شروع به ورزش های سنگین و سخت کنند، نیاز به پروتئین دارد. البته باید یادآور شد که پروتئین اضافی تبدیل به انرژی شده و حتی در بعضی مواقع به شکل چربی در بدن ذخیره می شود. به همین دلیل مصرف بالای اسیدآمینو ها وپروتئین ها به هیچ عنوان توصیه نمی شود. زیرا ممکن است علاوه بر ایجاد کمبود کلسیم، بار زیادی بر روی کلیه ها میگذارند که نیازمند تصفیه بیشتر مواد پروتئینی نیتروژن دار است.

 

نمایشی سه‌بعدی از ساختار میوگلوبین، که در آن مارپیچ‌های آلفا به صورت رنگی نشان داده شده‌اند. این پروتئین نخستین پروتئینی بود که ساختار آن توسط بلورنگاری پرتو ایکس حل شد.

پروتئینها یکی از انواع ماکرومولکول‌های زیستی هستند که از زیرواحدهایی بنام اسید آمینه ساخته شده‌اند. پروتئین‌ها، مانند زنجیری از یک کلاف سه‌بعدی بسپارهایی هستند که از ترکیب اسیدهای آمینه حاصل می‌شوند. چون ترتیب‌های نامحدودی در توالی و طول زنجیره اسید آمینه‌ها در تولید پروتئین‌ها وجود دارد، از این رو انواع بی شماری از پروتئین‌ها نیز می‌توانند وجود داشته باشند.

پروتئین‌های درون‌یاخته‌ای در بخشی از یاخته به نام ریبوزوم توسط RNA ساخته می‌شوند.

فهرست مندرجات

۱ کارکردهای پروتئین‌ها

۱.۱ یادآوری ویژگیهای فیزیکو– شیمیایی پروتئین ها

۱.۲ متابولیسم اسیدهای آمینه

۱.۳ مقدار مورد نیاز پروتئین برای یک ورزشکار

۱.۴ منابع غذایی پروتئین ها

۲ پروتئین و بیماری‌ها

کارکردهای پروتئین‌ها

 

رفتار سلولی و تمام فعالیت‌‌هایی که در سلول انجام می‌شود بر عهده پروتئین‌‌ها است. همه پروتئین‌ها با هم برهم‌کنش دارند و تقریباً می‌توان گفت که همه پروتئین‌ها اثر خود را با همکاری پروتئین‌های دیگر در سلول اعمال می‌کنند و هیچ پروتئینی نیست که در یاخته به تنهایی عمل کند. برای ساخت پروتئن در سلول مراحل ذیل باید انجام شود. 1) DNA باید رونویسی شود. در این مرحله آنزیم RNA پلی مراز دو رشته DNA از هم جدا میشود و بعد رونوسی آغاز میشود. نکته: اطلاعات در DNA بصورت رمز 3 تایی وجود دارد یعنی هر 3 نوکئوتید معرف 1 رمز و هر رمز معرف 1 اسید آمینه است. 2) RNA پلی مراز مانند قطاری بر روی DNA حرکت میکند. و رونوسی ادامه دارد. 3) بعد در آخر رونوسی RNA پلی مرآز به رمز پایان میرسد و رونویسی به پایان میرسد. محصول این رونویسی mRNA نام دارد. mRNA از هسته خارج میشود و در سیتوپلاسم به کمک نوع دیگر RNA به نام tRNA اسید آمینه را به هم متصل میکند. tRNA روی mRNA متصل میشودو طبق رمزهای tRNA, mRNA اسید آمینه ها را کنار هم می گذارد. و در آخر ذنجیره پلی پپتیدی به وجود می آید. نقش پروتئین ها در رژیم غذایی

پروتئین ها مواد مغذی اصلی هر سلول زنده هستند. در ساختمان آنها نه تنها کربن ، هیدروژن و اکسیژن وجود دارد، بلکه ازت و گاهی گوگرد نیز موجود می باشد. پروتئینها مسئول انجام اعمال گوناگونی هستند. نقش آنها از تشکیل ماده انقباضی عضلات گرفته تا ساختن بعضی از هورمون ها، آنزیم ها و آنتی کورها، تبدیل انرژی شیمیایی به کار و انتقال اکسیژن و هیدروژن متنوع می باشد.

یادآوری ویژگیهای فیزیکو– شیمیایی پروتئین ها

الف) از هیدرولیز پروتئین ها اسیدهای آمینه بدست می آید. تعداد اسیدهای آمینه بیست عدد می باشد که بعضی از آنها «اساسی» هستند که عبارتند از : لیزین, تریپتوفان فینل آلائین, متیونین, ترئونین, لوسین و والین و چون بدن انسان قادر نیست آنها را بسازد، حتماً باید توسط غذا تأمین گردند.

ب ) با ترکیب اسیدهای آمینه با هم، پلی پپتیدها بوجود می آیند. از ترکیب پلی پپتیدها با هم، تعداد قابل توجهی مولکول پروتئین حاصل شود.

متابولیسم اسیدهای آمینه

اسیدهای آمینه شکل نهایی متابولیسم پروتئین ها هستند، قابل انتشار بوده و شامل مواد ساده ای است که مصارف مختلفی دارند: الف) ذخیره موقتی در بافت ها ب) سنتز پروتئین ها: با اسیدهای آمینه بافتهای مختلف، پروتئین ها سنتز می شوند. ج) دز آمیناسیون – ترانس آمیناسیون: با سوختن اسید آمینه، بعد از آنکه اسید آمینه عامل آمینی (NH2) را از دست داد، یک اسید چرب باقی می ماند که حدوداً 90 درصد انرژی موجود در اسید آمینه را در بر می گیرد و در زمان کمبود انرژی یا مصرف بیش از حد پروتئین، اسید آمینه پس از دست دادن ازت خود می سوزد.همچنین اسیدهای آمینه در بدن با جا به جا کردن ازت (ترانس آمیناسیون) به یکدیگر تبدیل می شوند.

مقدار مورد نیاز پروتئین برای یک ورزشکار

پس از اینکه فرد ورزشکار از میزان انرژی مورد نیازش اطلاع کافی به دست آورد، بایستی 15 تا 17 درصد میزان انرژی را به دست آورده ، تقسیم بر عدد 4 کند ، عدد به دست آمده گرم پروتئین مورد نیاز ورزشکار است که باید از طریق غذا در طول روز تامین شود. برای ورزشکارانی که نیاز به افزایش حجم عضلات دارند، از 17 درصد و برای دیگر ورزشکاران از 15درصد انرژی، برای محاسبه پروتئین مورد نیاز باید استفاده کرد.

17 – 15 درصد میزان انرژی مورد نیاز ورزشکار (تقسیم بر) 4 = گرم پروتئین مورد نیاز ورزشکار

منابع غذایی پروتئین ها

پروتئین ها بخشی از ترکیبات مواد غذایی هستند که با مقدارهای مختلف در آنها موجودند. پروتئین های دارای منشاء حیوانی کیفیت خوبی دارند. با وجود این بعضی از مواد غذایی گیاهی «حبوبات، غلات، نان...) دارای مقادیر کمی پروتئین هستند که ارزش حیاتی آنها پایین تر از پروتئین های حیوانی است، اما به مقدار آنها جالب توجه هستند. در مورد منابع غنی از پروتئین بطور کامل توضیح می دهیم:

1-گوشت قرمزگوشت های گاو، گوسفند، اسب، صرف نظر از آنکه چه قسمتی از بدن حیوان باشد، دارای ویژگیهای تغذیه ای شبیه به هم هستند. مزّیت تغذیه ای گوشت به غنای پروتئینی آن بستگی دارد (15 تا 20% گوشت، پروتئین است). گوشت غنی از فسفر، آهن و ویتامین های گروه B (مخصوصاً B1 ) است. میزان چربی های آن بر حسب نوع حیوان و قسمت بدن به طور قابل توجهی متغیراست. به طور متوسط 170 کیلوکالری برای هر 100 گرم، انرژی تولید می کند. ارزش غذایی « گوشت قرمز برابر گوشت سفید» است. گوشت کاملاً پخته شده همان ارزش گوشت خام یا گوشتی را دارد که مختصراً پخته شده باشد. اما پختن کامل برای از بین بردن انگل ها (مخصوصاً تنیا ) لازم است.

ویژگیهای خاص بعضی از گوشت های قرمز - گوشت گوسفند اغلب چرب است، حتی وقتی کم چربی ترین بخش های آنها مصرف گردد. - گوشت گوساله غنی از نوکلئوپروتئین ها است و مصرف خیلی زیاد آن می تواند عمل عضلات را مختل کند. - اسب دارای گوشت کم چربی است (2% چربی). برخلاف آنچه مدتهای مدید فکر می شد، نباید بصورت خام مصرف شود. - گوشت ها ترجیحاً بهتر است بصورت کباب یا بریان شده مصرف گردند و از گوشتهای سرخ شده، روغن پرشده، آبگوشت و سس های چرب که دارای هضم مشکل هستند، خودداری شود.

- گوشتهای چرخ شده نباید مصرف گردند، مگر با رعایت احتیاط کافی و بصورت گوشت چرخ شده و یخ زده . اگر گوشت


دانلود با لینک مستقیم


تحقیق پروتئین ها 18 ص

دانلود پاورپوینت زیست شناسی پایه پیش دانشگاهی تجربی مبحث از ژن تا پروتئین - 39 اسلاید

اختصاصی از رزفایل دانلود پاورپوینت زیست شناسی پایه پیش دانشگاهی تجربی مبحث از ژن تا پروتئین - 39 اسلاید دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

دانلود پاورپوینت زیست شناسی پایه پیش دانشگاهی تجربی مبحث از ژن تا پروتئین - 39 اسلاید


دانلود پاورپوینت زیست شناسی پایه پیش دانشگاهی تجربی مبحث از ژن تا پروتئین - 39 اسلاید

 

 

 

به عمل تبدیل اطلاعات DNA  به RNA  رونویسی گویند  این عمل هم مثل تمام اعمال سلولی برای انجام، نیاز به آنزیم دارد . آنزیمی که در رونویسی نقش دارد RNA پلیمراز نام دارد.

مناسب برای دانش آموزان و دبیران و اولیا

برای دانلود کل پاورپوینت از لینک زیر استفاده کنید:


دانلود با لینک مستقیم


دانلود پاورپوینت زیست شناسی پایه پیش دانشگاهی تجربی مبحث از ژن تا پروتئین - 39 اسلاید

دانلود پروژه استفاده از روش‌های شبکه عصبی در طبقه‌بندی پروتئین ها

اختصاصی از رزفایل دانلود پروژه استفاده از روش‌های شبکه عصبی در طبقه‌بندی پروتئین ها دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

دانلود پروژه استفاده از روش‌های شبکه عصبی در طبقه‌بندی پروتئین ها


دانلود پروژه استفاده از روش‌های شبکه عصبی در طبقه‌بندی پروتئین ها

لینک پرداخت و دانلود *پایین مطلب*
فرمت فایل:Word (قابل ویرایش و آماده پرینت)
تعداد صفحه: 20
فهرست و توضیحات:

استفاده از روش‌های شبکه عصبی در
طبقه‌بندی پروتئین‌ها

پروژه درس مباحث ویژه پایگاه‌ داده‌ها

عناوین

چکیده

فهرست شکل‌ها

شکل 1: یک شبکه پرسپترونی سه لایه

شکل 2: تاثیر ورودی از نرون i با وزن بر نرون j

شکل 3: نرخ طبقه‌بندی صحیح برای طبقه بندی کننده‌های MLP

شکل 4: نرخ طبقه‌بندی صحیح برای طبقه بندی کننده‌های RBF

 

چکیده

تشخیص فولد پروتئین‌ها از جمله مسائل چالش برانگیزی است که در طی 35 سال گذشته محققان بسیاری در سراسر دنیا در این زمینه تحقیق کرده‌اند. امروزه به کارگیری علوم مهندسی برای حل مسائل حوزه علوم زیستی و پزشکی به سرعت و با موفقیت رو به افزایش است، بنابراین بسیاری از دانشمندان کامپیوتر به این سمت گرایش پیدا کرده‌اند تا بتوانند از روش‌های مختلف یادگیری ماشین در پیاده سازی سیستم‌های خودکار و هوشمند به منظور طبقه‌بندی پروتئین‌ها کمک بگیرند. هدف نهایی  در پیاده سازی این سیستم‌ها  نزدیک بودن هرچه بیشتر تصمیم اتخاذ شده توسط ماشین به تصمیم فرد خبره بیولوژیست می‌باشد.

با این وجود به خاطر پیچیدگی بسیار این مساله که ناشی از تعداد کلاس‌های نسبتا زیاد پروتئین‌ها و بزرگ بودن ابعاد ویژگی آنهاست، بدست آوردن جواب قابل قبول در طبقه‌بندی پروتئین‌ها با استفاده از روش‌های معمول یادگیری ماشین تقریبا امکان پذیر نمی‌باشد.  در این پژوهش ما از یک مدل ترکیبی طبقه‌بندی با استفاده از  شبکه های عصبی MLP، RBF و روش ترکیب طبقه بندی کننده‌های بیزی برای تعیین فولد پروتئین ها استفاده کرده‌ایم. نتایج بدست آمده نشان می‌دهد که شبکه‌های عصبی RBF دارای نرخ طبقه بندی صحیح بهتری نسبت به سایر روش‌ها مانند MLP و ماشین‌های بردار پشتیبان داشته است. این امر می‌تواند به علت فضای جستجوی بسیار بالا برای یافتن پارامترهای بهینه ماشین‌های بردار پشتیبان و زمان نسبی زیاد یادگیری در این نوع طبقه بندی کننده‌ها باشد. همچنین نتایج بدست آمده نشان می‌دهد که نرخ طبقه بندی صحیح پروتئین‌ها با استفاده از روش ترکیب بیزی به ٪59 افزایش یافته است. که البته در مقاله دیگری توانسته‌اند با استفاده از کلاسیفایر svm به 62.5٪  برسند. که نشان می‌دهد هنوز این پژوهش نیاز به بررسی بیشتر دارد.

1.  مقدمه

پروتئین‌ها ماکرومولکول‌های بیولوژیک بزرگی هستند که اجزاء اصلی ارگانیسم‌های زنده را تشکیل می‌دهند و تمام اعمال حیاتی آنها را کنترل می‌کنند. عملکرد یک پروتئین مربوط به واکنش‌های شیمیایی پروتئین با محیط اطراف و سایر پروتئین‌ها می‌باشد. از طرف دیگر خود این امر وابسته به شکل و ساختار سه بعدی پروتئین و نحوه فولدینگ اجزاء آن می‌باشد. تعیین ساختار سه‌بعدی پروتئین به طور تجربی بسیار دشوار است و از آنجایی‌که معمولا ترتیب زنجیرة هر پروتئین دانسته است، پژوهشگران می‌کوشند تا با استفاده از روش‌های زیست‌فیزیکی گوناگون پدیده تاخوردگی پروتئین‌ها را مدل کرده و به این ترتیب ساختار سه‌بعدی نهایی را از روی دنبالة اسیدهای آمینه پیش‌بینی کنند. بر اساس باور بسیاری از پژوهشگران  پروتئین‌ها برای عملکرد صحیح می‌بایست ساختار سه‌بعدی درست خود را بدانند. لذا اگر پروتئینی نتواند به ساختار درست خود تا شود، غیرفعال خواهد شد. دلیل برخی از بیماری‌ها انباشتگی پروتئین‌های بد تاخورده پنداشته می‌شود.

انبوه پروتئین‌های تعیین توالی شده که در صف طویل تعیین خواص ساختاری و شناسایی عملکرد قرار گرفته‌اند، نیاز به روش‌های محاسباتی برای تعیین ساختار و توپولوژی پروتئین‌ها را آشکار می‌سازد. این  مساله به عنوان یکی از چالش های 35 سال اخیر دانشمندان بیولوژی توجه بسیاری از محققان علوم کامپیوتر را به خود جلب کرده است ‎. با این وجود به دلیل طبیعت پیچیده ناشی از تعداد زیاد کلاس‌های پروتئین و همچنین بالا بودن ابعاد فضای ویژگی، عموما روش‌های معمول یادگیری ماشین به نتایج چندان رضایت بخشی نمی‌رسند . در چنین مسائل طبقه‌بندی فرض می‌شود که فولدهای ممکن محدود است و هر پروتئین به کلاس یکی از انواع محدود فولدها تعلق دارد. می‌توان گفت شناسایی الگوی فولد یک پروتئین در سطحی عمیق‌تر از شناسایی کلاس ساختارهای نوع دوم پروتئین قرار می‌گیرد و به طبع دشوارتر و پیچیده‌تر از آن است. دشواری این مساله از آنجا ناشی می‌شود که با توجه به ساختارهای نوع دوم تشکیل دهنده پروتئین تعداد زیادی توپولوژی شناخته شده می‌توانند کاندید انتخاب به عنوان توپولوژی مناسب برای یک پروتئین با توپولوژی ناشناخته شوند.

روش استفاده شده در این تحقیق برای روبرو شدن با چنین مساله دشواری ترکیب تصمیم‌هایی است که هر یک با توجه به زاویه دیدی متفاوت به موضوع اتخاذ شده‌اند. در این تحقیق کلاسیفایرهای مورد استفاده در مواردی چون شناسایی ساختار دوم، آبگریزی ، حجم واندروالس، قطبیت،  و قابلیت قطبی شدن از روی مجموعه داده‌های آموزش به خبرگی مورد نیاز رسیده‌اند.

در این پژوهش ما از یک مدل ترکیبی طبقه‌بندی با استفاده از  شبکه‌های عصبی MLP، RBF و روش ترکیب طبقه بندی کننده‌های بیزی برای تعیین فولد پروتئین‌ها استفاده کرده‌ایم. در ادامه در بخش دوم این گزارش ابتدا مقدمه‌ای مختصر درباره شبکه‌های عصبی مصنوعی آورده شده است. بخش سوم به شرح روش رای گیری اکثریت و همچنین روش  بیز در ترکیب تصمیم طبقه بندی کننده‌های مختلف می‌پردازد.  در بخش چهارم به بیان مشخصات داده‌ها و همچنین عملیات‌های انجام شده به منظور آماده سازی داده‌های مساله پرداخته‌ایم. در بخش‌های پنجم و ششم و هفتم نیز به ترتیب نتایج آزمایشات، مقایسه با کارهای انجام شده قبلی و کارهای آینده آورده شده است.

این فقط قسمتی از متن پروژه است . جهت دریافت کل متن پروژه ، لطفا آن را خریداری نمایید


دانلود با لینک مستقیم


دانلود پروژه استفاده از روش‌های شبکه عصبی در طبقه‌بندی پروتئین ها